Istnieją dwie metody automatycznego uruchamiania programów podczas uruchamiania systemu Windows 3.11.
Najpierw utwórz ikonę tego, co chcesz zacząć. Lub skopiuj ikonę tego, co chcesz uruchomić, i umieść ją w grupie startowej w Menedżerze programów. Wszystko w grupie startowej zostanie automatycznie uruchomione po każdym uruchomieniu systemu Windows.
Alternatywnie, z MS-DOS, wpisując win możesz dodać program, który chcesz uruchomić po poleceniu. Na przykład wpisanie wygranego notatnika uruchomi system Windows i automatycznie uruchomi notatnik.